上海海洋大学《分子生态学》课件-20分子生态学+系统发生树 .pdf

第四节二叉树

遗传谱系进化关系也可以通过系统发育(phylogeny)重建从DNA序

列上获取。

一、系统发育分析

系统发育分析就是根据特征或距离数据确定其基因、物种起源和发

生关系的方法。分子系统发育分析直接利用从核酸或蛋白质序列提取的

信息作为物种的特征，通过比较生物大分子的序列，分析序列之间的关

系，构造系统发育树，进阐明各个物种的进化关系。

rRNA为细胞所共有，其功能同源且最为古老，既含有保守序列又

含有可变序列的分子大小适合操作，它的序列变化与进化距离相适应，

保守性能够反映生物物种的亲缘关系，为系统发育重建提供线索，高变

性则能揭示出生物物种的特征核酸序列，是属种鉴定的分子基础。

第四节二叉树

遗传谱系进化关系也可以通过系统发育(phylogeny)重建从DNA序

列上获取。人

Treescale;1i-

第四节二叉树

二、分层二叉树

在研究生物系统发育过程中，常用一种树状分图来概括各生物之间

的亲缘关系，这种表征物种或序列进化关系的树状分支图就称为系统发

育树（系统树或进化树）。系统发育推断主要是以分层二叉树的形式进

行描述。分层二叉树反映的就是一系列分支过程，即一个谱系分化成两

个子代谱系。

Cordulegasterdorsalis\Cordulegastndae

二叉树由节点和分支组成，Anaxjunius

AeshnamulticolorAeshnidae

节点表示进化过程中一个物节占Aeshnacalifornica

I—TrameaIacerata

种分歧为两个独立繁衍的物P"Trameaonusta

LLibellulasaturata

ILibellulaluctuosa

种，节点之间的连线代表物PachydiplaxlongipennisLibellulidae

分支J

Sympetrumillotum

种之间的进化关系。Perithemistenera

Erythemissimplicicollis